电影《水形物语》讲的是人鱼和人类哑女之间的爱情故事，二十世纪六十年代，哑女艾丽莎在政府实验室做清洁工，偶遇一只被实验室从美洲抓回来的人鱼，二人阴差阳错擦出火花，最后人鱼把死了的艾丽莎变成人鱼，双宿双飞了。
艾丽莎因小时候一场大病不能再开口说话，一直一个人生活，但艾丽莎很向往爱情。人鱼是美洲土著居民的神，被美国军队强行抓回来制作生物武器。
艾丽莎对人鱼很有好感，在艾丽莎眼中，人鱼和自己一样都是孤独的人，不应该被实验室折磨。所以艾丽莎偷偷看完人鱼，给人鱼带东西吃，教他手语。
甚至是联合朋友悄悄把人鱼带回家里，只是人鱼离不开盐水，很快就生病了。艾丽莎打算忍痛放人鱼离开，却在离开的时候遭到反派理查德的阻拦，艾丽莎为救人鱼而死。人鱼在水中将艾丽莎转化成人鱼，二人终于可以在一起了。