《黑凤凰》琴黑化和她体内的凤凰之力失去控制有关。在琴黑化后，X战警内部出现不同的声音，有人想拯救琴，有人想毁灭琴，超级英雄们经历前所未有的考验。
电影《X战警黑凤凰》中，琴·葛蕾得到一股强大的宇宙能量，变得比以前更强大。外星人跟随那股宇宙能量来到地球，想将宇宙能量收走。但是，那股力量留在琴·葛蕾体内，想要做到这件事不那么容易。
后来，随着身世之谜的揭开，琴·葛蕾受到刺激，逐渐失去理智，那股强大的能量也有失控的迹象。外星人用琴·葛蕾的身世大做文章，挑拨她和X战警其他成员的关系，琴·葛蕾走向黑化。
在X战警内部，出现两种意见，一部分人希望拯救琴·葛蕾，让她变回以前的样子，一部分人提议消灭黑化的她。所有人都经历着考验。