邪剑仙来历是，他是蜀山几位长老的邪念凝结而成。当年，蜀山几位长老将自身的邪念逼出体内，锁在一个盒子里。然后，就有了邪剑仙。
《仙剑奇侠传三》中，邪剑仙原本只是一团邪气，没有实体。蜀山几位长老将它锁进盒子，又将盒子镇压在锁妖塔，本来相安无事。
但是，邪剑仙非常邪门，能够吸收负面能量壮大自身。为了防止他从盒子里逃出来，对六界造成危害，几位长老决定把他送到天池消灭。虽然邪剑仙死的时候，几位长老也会死，但是他们已经做好心理准备。
负责送盒子、消灭邪剑仙的有两位人选，他们一个是蜀山大弟子徐长卿，一个是永安当小伙计景天。
在天池的时候，徐长卿得知邪剑仙的来历，私自放跑了他。随着邪剑仙越来越强大，人间迎来一场前所未有的浩劫。