《四海鲸骑》建文结局是，得知郑提督一剑刺死先皇的真相，和郑提督化解恩怨。经历这一切，他不再是不谙世事的少年，成长为有担当的男人。百地七里和他走到一起。
《四海鲸骑》中，建文本是大明的太子，生性仁慈善良。
听闻佛岛的传说，先帝携水师入南洋，弄得民不聊生。郑提督一剑刺杀先帝，被建文目睹。又惊又怒的他携传国玉玺逃走，消失的无影无踪。
四年后，新皇帝登基。隐姓埋名的建文在泉州港以鉴宝为生。日本少女百地七里邂逅建文，害建文惹上新的麻烦。加上蒙古水师提督腾格斯，他们三人开启海上冒险之旅。
结局里，建文终于找到佛岛。得知郑提督杀死先皇另有隐情，建文选择原谅他，他们又恢复到亦师亦友的关系。百地七里对建文日久生情，两人走到一起。